Berlatar di Jepang dan waktu musim panas tahun 2015. Ada 180 ribu orang yang tinggal di Kota Tachikawa, sebuah kota metropolis kedua setelah Tokyo. Di sana, terdapat organisasi bernama Gatchaman yang menggunakan kekuatan special bernama “NOTE” untuk bertarung. NOTE adalah kekuatan yang terwujud karena suatu hal berbau spiritual. Suatu hari, organisasi ini memutuskan untuk mendatangkan sekumpulan orang dengan tujuan menjadi pelindung Bumi yang akan diserang oleh Alien. Sesuai dugaan, anggota Gatchaman tengah terlibat dalam sebuah kasus yang melibatkan makhluk misterius bernama “Vape”.  Untuk menghadapi musuh baru ini, Gatchaman menggunakan teknologi CROWDS, sebuah sistem yang dikembangkan oleh salah satu anggota Gatchaman.