Shiroi Suna no Aquatope bercerita dengan Miyazawa Fuuka gadis muda yang mempunyai cita-cita dari kecil menjadi seorang Idol. Tapi walaupun dia memiliki wajah yang manis dan tampilan yang menjanjikan, kepribadiaan dia yang kurang ceria membuatnya susah bertahan di dunia hiburan. Lalu dirinya memutuskan berhenti dari agensi dan berniat pulang ke kampung halaman. Tapi dia merasa tidak enak harus pulang dengan membawa kegagalan.

Dan entah kesambet apa dirinya malah pergi ke provinsi paling timur di jepang, ya dia pergi ke Okinawa. Selama di Okinawa dia melakukan perjalanan sendiri dan pergi kebeberapa tempat pariwisata yang ada disana. Salah satunya ke Sea World Guma Guma Aquarium, salah satu tempat wisata unggulan di Okinawa pada masanya. Tempat tersebut mulai sepi dan banyak di tinggal oleh wisatawaan. Entah gimana Fuuka merasa nyaman di tempat wisata tersebut dan suka melihat koleksi-koleksi ikan yang di miliki oleh Guma Guma Aquarium.

Disana dia juga bertemu dengan seorang gadis penerus dari tempat wisata tersebut Misakino Kukuru. Sedangkan Kukuru adalah gadis yang penuh semangat dan selalu optimis, dia sangat menyukai ikan dan binatang laut lainnya. Ketika Kukuru menjelaskan kalau tempat wisatanya tersebut kekurangan orang, Fuuka dengan semangat ingin berkerja disana. Jadi inilah kisah seorang mantan idol yang insaf lalu berkerja di objek wisata Sea World yang hampir gulung tikar!