Fukumenkei Noise bercerita tentang seorang gadis muda mengenakan masker berdiri di tepi pantai dan menyanyikan lagu melodi nostalgia . Setelah mengalami dua derita yang memilukan saat dia masih kecil , Nino Arisugawa selalu menyanyikan lagu-lagu yang sedih ke lautan , terikat oleh sebuah janji yang dibuat dengan dua teman masa kecilnya yaitu cinta pertamanya , Momo Sakaki dan seorang anak laki-laki yang mengajarkannya tentang musik bernama Kanade “Yuzu” Yuzuriha . Setelah tidak pernah bertemu satu sama lain , kedua anak laki-laki tersebut secara pribadi berjanji bahwa jika Nino pernah terpisah dari mereka , suaranya akan menjadi suar untuk menyatukan mereka kembali .

Setelah enam tahun lamanya berlalu , takdir akhirnya menempatkan Nino , Momo dan Yuzu di SMA yang sama . Namun , perjalanan waktu telah mengubah banyak hal dalam hidup mereka . Sementara Nino tanpa henti berusaha memenuhi janji masa kecilnya dengan mereka berdua , perasaan cinta Yuzu untuknya dari masa lalu muncul kembali dan Momo berusaha keras untuk mencegah perasaan tersebut . Melalui musik , apakah mereka bisa memperbaiki persahabatan mereka dan mengatasi semua perasaan yang terlibat dalam segitiga cinta yang rumit ini ?!