Gundam Unicorn Koloni manufaktur Industrial 7, yang masih dalam proses pembangunan, mengapung di Lagrange point 1. Seorang pemuda bernama Banagher Links, yang tumbuh tanpa mengetahui ayahnya, bertemu dengan seorang gadis misterius yang telah disimpan jauh di kapal menuju Industrial 7. Sebagai mobile suit putih Unicorn mengalami tes berulang-ulang dan menjadi subjek dari beragam spekulasi, tangan waktu mulai bergerak.