Koukyuu no Karasu terjadi sebuah penggulingan tahta di kekaisaran, kaisar baru menduduk tahtanya dan melakukan perubahan di dalam Istana. Tapi jauh di dalam istana hidup seorang permaisuri khusus yang tidak melayani kaisar meskipun posisinya, yang dikenal sebagai Permaisuri Gagak. Orang-orang yang melihatnya mengatakan dia terlihat seperti wanita tua, sementara yang lain mengatakan dia terlihat seperti gadis muda. Cerita berbicara tentang penggunaan seni misterius dan bagaimana dia dapat menerima permintaan apa pun, baik itu kutukan kematian hingga menemukan barang yang hilang. Koushun, kaisar saat ini, pergi mengunjungi Permaisuri Gagak dengan niat itu, tanpa mengetahui bahwa pertemuan takdir mereka akan menjadi tabu yang akan membalikkan sejarah.