Ninja Ryuukenden Pada malam yang kelam di Kota New York, Ryu dikejar dan diserang oleh seorang pembunuh. Setelah berhasil menyingkirkan penyerangnya, Ryu menemukan kartu identitas untuk Perusahaan Friedman. Pada hari berikutnya, diumumkan bahwa Dr. Ned Friedman menemukan obat untuk kanker. Namun, setelah tidak memberikan rincian pada konferensi pers, seorang reporter bernama Sarah memutuskan untuk menyelidiki bersama teman-temannya Robert dan Jeff.

Saat melewati rumah Dr. Friedman, Ryu mendengar suara seorang gadis muda yang meminta pertolongan. Ketika Sarah dan timnya juga menyelidiki rumah tersebut, mereka bertemu dengan rekan mereka, Ryu. Selanjutnya, mereka menemukan bahwa Dr. Friedman telah melakukan eksperimen pada manusia menggunakan bioteknologi, dan hal ini mungkin terkait dengan kekuatan Dewa Jahat yang pernah dikalahkan oleh Ryu di masa lalu.

Namun, ketika teman Ryu, Irene, diculik, dia dipaksa untuk mengambil peran sebagai Ninja Naga sekali lagi untuk menghadapi musuh baru ini dan menyelamatkannya.