Nisemonogatari bercerita, bertahan dalam serangan vampir, bertemu beberapa gadis yang diganggu oleh kekuatan supernatural dan hanya mencoba menjalani hidup adalah beberapa hal yang harus ditanganinya akhir-akhir ini oleh siswa SMA bernama Koyomi Araragi.

Di atas semua itu, dia bangun suatu pagi untuk menemukan dirinya diculik dan diikat oleh pacarnya Hitagi Senjougahara. Setelah bertengkar dengan Deishuu Kaiki, seorang penipu yang menipu ibu Senjougahara, dia membawanya ke pemenjaraan Araragi untuk menjaganya agar tetap aman dari si penipu. Tapi saat Araragi mendapat pesan panik dari saudaranya Karen, dia menyadari bahwah masalah itu telah menyeret keluarganya juga.

Seiring dengan masalah Karen, adik perempuannya yang lain, Tsukihi, memiliki masalah sendiri. Dan ketika dua wanita misterius yang tampaknya lebih tahu daripada yang seharusnya mereka miliki tentang Araragi dan kelompok teman istimewanya masuk ke dalam kehidupan mereka, bahkan dia pun tidak bisa mengantisipasi tujuan sebenarnya mereka, atau kebenaran bencana segera terungkap.