Taiyou yori mo Mabushii menceritakan kisah Sae Iwata dan Kouki Kamishiro, dua teman masa kecil dengan kepribadian yang sangat berbeda. Sae dikenal sebagai gadis yang kuat dan mandiri, sementara Kouki kecil adalah anak laki-laki yang lemah, mungil, namun selalu tersenyum ramah.

Sejak masa sekolah dasar, Sae diam-diam menyimpan perasaan cinta pertama pada Kouki. Namun, seiring berjalannya waktu, keduanya tumbuh dan berubah. Memasuki masa SMP hingga SMA, Kouki berkembang menjadi remaja yang tinggi, tampan, dan populer, sosok yang terasa jauh dari anak kecil yang dulu selalu dilindungi Sae.

Merasa tidak pantas dan mulai ragu dengan perasaannya, Sae berusaha menjaga jarak. Tetapi takdir mempertemukan mereka kembali saat festival olahraga sekolah, dan perasaan lama yang sempat terkubur pun kembali muncul. Sae mulai menyadari bahwa cintanya pada Kouki belum pernah benar-benar padam.

Namun, di masa SMA, segalanya tak sesederhana dulu. Sae bukan satu-satunya gadis yang menaruh hati pada Kouki, dan ia pun harus berhadapan dengan kenyataan baru—apakah Kouki masih menyimpan rasa yang sama untuknya?